コーデックによるようですが、4Kフレームサイズで書き出しが可能でした。
手元に3840x2160の素材しかなかったんですけど、そのままのサイズで書き出し出来ています。（Win7、PrPrCC2014で確認）
試したのはQuicktime形式、MPEG4＆GoProCineform(こっちはCC2014からのはず)コーデックです。
Quicktime形式の中でもコーデック：H.264はダメでしたー。2000x2000で上限のようです。
ちょっとコーデックの仕様に明るくないんですけど、仕様上制限があるんでしょう。